Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Lhx9Q9WUH2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Lhx9Q9WUH2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms