Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUB0

Rbck1, RanBP-type and C3HC4-type zinc finger-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbck1Q9WUB0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rbck1Q9WUB0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rbck1Q9WUB0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms