Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nrf1Q9WU00 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Nrf1Q9WU00 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms