Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trpv2Q9WTR1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms