Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM4

Nfe2l3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfe2l3Q9WTM4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2l3Q9WTM4 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2l3Q9WTM4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Nfe2l3Q9WTM4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Nfe2l3Q9WTM4 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms