Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTK8

Spo11, Meiotic recombination protein SPO11, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spo11Q9WTK8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Spo11Q9WTK8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Spo11Q9WTK8 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Spo11Q9WTK8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms