Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TapbpQ9R233 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TapbpQ9R233 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TapbpQ9R233 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TapbpQ9R233 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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TapbpQ9R233 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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