Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Psma1Q9R1P4 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Psma1Q9R1P4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms