Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tmed2Q9R0Q3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmed2Q9R0Q3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms