Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Krt71Q9R0H5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Krt71Q9R0H5 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms