Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh2d3cQ9QZS8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms