Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ercc4Q9QZD4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ercc4Q9QZD4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms