Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PnckQ9QYK9 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms