Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pkp3Q9QY23 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms