Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Foxe3Q9QY14 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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