Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV1

Cbx8, Chromobox protein homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx8Q9QXV1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Cbx8Q9QXV1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms