Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pcsk1nQ9QXV0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms