Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Limd1Q9QXD8 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Limd1Q9QXD8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms