Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Homer2Q9QWW1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms