Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PdcQ9QW08 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
PdcQ9QW08 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms