Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUN9

Dkk3, Dickkopf-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dkk3Q9QUN9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dkk3Q9QUN9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms