Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PolkQ9QUG2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolkQ9QUG2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms