Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms