Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMC8

Epb41l4b, Band 4.1-like protein 4B, mousemouse

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Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l4bQ9JMC8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Epb41l4bQ9JMC8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Epb41l4bQ9JMC8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Epb41l4bQ9JMC8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Epb41l4bQ9JMC8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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