Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

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Length 95 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Higd1aQ9JLR9 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
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