Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cabp1Q9JLK7 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cabp1Q9JLK7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms