Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ0

Litaf, Lipopolysaccharide-induced tumor necrosis factor-alpha factor homolog, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LitafQ9JLJ0 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LitafQ9JLJ0 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms