Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CtsmQ9JL96 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CtsmQ9JL96 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms