Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL61

Rfx5, DNA-binding protein Rfx5, mousemouse

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx5Q9JL61 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
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Rfx5Q9JL61 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx5Q9JL61 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx5Q9JL61 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx5Q9JL61 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rfx5Q9JL61 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rfx5Q9JL61 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Rfx5Q9JL61 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rfx5Q9JL61 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rfx5Q9JL61 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rfx5Q9JL61 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Rfx5Q9JL61 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rfx5Q9JL61 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Rfx5Q9JL61 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Rfx5Q9JL61 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rfx5Q9JL61 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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