Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cnot9Q9JKY0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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