Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scamp4Q9JKV5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scamp4Q9JKV5 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms