Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 G530012D18Rik-201ENSMUST00000178024 420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Irx5Q9JKQ4 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms