Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nectin1Q9JKF6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms