Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ybx3Q9JKB3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ybx3Q9JKB3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms