Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB1

Uchl3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L3, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl3Q9JKB1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Uchl3Q9JKB1 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Uchl3Q9JKB1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Uchl3Q9JKB1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Uchl3Q9JKB1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Uchl3Q9JKB1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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