Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba8Q9JJZ2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba8Q9JJZ2 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba8Q9JJZ2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba8Q9JJZ2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba8Q9JJZ2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba8Q9JJZ2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba8Q9JJZ2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tuba8Q9JJZ2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Tuba8Q9JJZ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tuba8Q9JJZ2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms