Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smpd3Q9JJY3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smpd3Q9JJY3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms