Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc86Q9JJ89 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc86Q9JJ89 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms