Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIW5

Smad9, Mothers against decapentaplegic homolog 9, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad9Q9JIW5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Smad9Q9JIW5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Smad9Q9JIW5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms