Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Lmbr1Q9JIT0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Lmbr1Q9JIT0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms