Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cldn19Q9ET38 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn19Q9ET38 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Cldn19Q9ET38 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cldn19Q9ET38 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Cldn19Q9ET38 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cldn19Q9ET38 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms