Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET30

Tm9sf3, Transmembrane 9 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm9sf3Q9ET30 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tm9sf3Q9ET30 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms