Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Trim2Q9ESN6 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Trim2Q9ESN6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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