Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ropn1Q9ESG2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms