Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
OtofQ9ESF1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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