Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERT2

Trhr2, Thyrotropin-releasing hormone receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trhr2Q9ERT2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trhr2Q9ERT2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trhr2Q9ERT2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms