Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Slco1c1Q9ERB5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms