Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER74

Sall1, Sal-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall1Q9ER74 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sall1Q9ER74 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms