Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Capn12Q9ER56 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms