Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx12Q9ER00 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stx12Q9ER00 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms